Prédiction de structures secondaires de protéines

Les protéines sont des composants biologiques importants constitués par l’assemblage de briques élémentaires, les acides aminés. L’organisation tridimensionnelle d’une protéine est cependant difficile à prédire à partir de la succession d’acides aminés. Dans cet article, nous allons détailler une étape importante dans le processus de construction d’un modèle tridimensionnel, la prédiction d’éléments de structure secondaire remarquables.

Au sommaire de l’article

1 Composition des protéines et difficultés de prédiction de la structure tridimensionnelle

2 Approches méthodologiques pour la prédiction des éléments de structure secondaire

3 Remplacer l’humain avec du machine learning

3.1 PSIPRED : étape 1, rechercher les séquences similaires

3.2 PSIPRED, étape 2 : prédiction de l’état secondaire

3.3 PSIPRED, étape 3 : validation et performance

Conclusion

Stéphane Téletchéa

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